惠州牙膏注册备案的办理流程可以参考以下步骤：
准备阶段：了解牙膏备案的相关法规和规定，包括《化妆品监督管理条例》、《化妆品注册备案管理办法》等。同时，整理和收集牙膏的配方、原料、生产工艺、检验报告等相关资料，以确保牙膏的质量和安全性符合国家相关法规和标准。
产品备案资料准备：准备牙膏备案申请表、产品名称命名依据、产品配方含原料安全信息、产品执行的标准、产品标签样稿、产品检验报告、产品安全评估资料以及产品在境外的自由销售证明（如果是进口牙膏）等。
备案申请：将准备好的资料提交给国家药品监督管理部门进行备案申请。在申请时，需要按照相关规定缴纳备案费用，并提交完整的备案资料。
审核阶段：国家药品监督管理部门会对提交的资料进行审核，并对牙膏的质量和安全性进行评估。如果审核不通过，需要根据审核意见进行整改并重新提交资料。审核通过后，国家药品监督管理部门会颁发备案凭证，并公布备案信息。
公布阶段：国家药品监督管理部门会公布牙膏的备案信息，包括企业名称、产品名称、配方、原料、生产工艺等信息。消费者可以根据这些信息选择适合自己的牙膏产品。
至于惠州牙膏的医疗器械CE认证办理流程，可以参考以下步骤：
向认证机构提出认证申请，并填写认证询价单交认证机构。
认证机构向申请认证企业提出报价单，企业签字确认即完成合约。
企业向认证机构提交ISO9000+ISO13485质量体系文件，包括质量手册和程序文件，供认证机构进行体系文件审核。在体系文件审核前，企业应有至少三个月的质量体系运行记录，并完成1~2次内部质量体系审核。
认证机构发出认证产品测试通知单给其认可的试验室，试验室将对申请认证的产品进行低电压（LVD）测试和电磁兼容性（EMC）测试。测试中若出现不合格，由企业改正后重新测试，直到测试合格为止。测试结束后，试验室出具试验报告。