惠州牙膏注册备案的办理流程如下：
准备申请材料：需要准备产品的相关信息，如产品名称、成分、功效、使用方法等，以及企业的营业执照、生产许可证等资质证明。
提交申请：将准备好的申请材料提交给惠州市食品药品监督管理部门。
形式审查：惠州市食品药品监督管理部门会对申请材料进行形式审查，检查申请材料是否齐全、是否符合要求。
实质审查：如果申请材料通过形式审查，惠州市食品药品监督管理部门会对产品进行实质审查，对产品的质量、安全性、有效性等进行评估。
备案决定：根据审查结果，惠州市食品药品监督管理部门会做出是否准予备案的决定。如果准予备案，会颁发备案凭证。
公布信息：在惠州市食品药品监督管理部门网站上公布备案信息，供公众查询。
对于三类医疗器械许可证的申请流程，可以参考以下步骤：
申请人需要了解相关的法律法规和标准要求，确保自己具备申请三类医疗器械许可证的资格和条件。
准备申请材料：申请人需要准备相关的申请材料，包括企业基本情况、产品技术要求、生产及质量管理体系文件等。
提交申请：申请人需要向所在地省级药品监督管理部门提交申请，并按照要求提供相关材料。
形式审查：省级药品监督管理部门对申请材料进行形式审查，核实材料的完整性和真实性。
现场检查：对于需要进行现场检查的医疗器械，省级药品监督管理部门会组织专家进行现场检查，核实产品的质量管理体系和生产条件等是否符合要求。
审核批准：如果申请材料和现场检查都符合要求，省级药品监督管理部门会颁发三类医疗器械许可证，准予企业在规定范围内生产和销售相应的医疗器械产品。